Phối cảnh đoạn trên cao đầu tiên để tàu đi từ khu depot Nhổn ra ga Nhổn.
Ga S1, Nhổn - trên Quốc lộ 32 gần trường Đại học Công nghiệp có 2 cầu thang lên xuống ở 2 bên Quốc lộ 32.
Ga S3 - Phú Diễn, gần đường ray tàu hỏa trên QL32 và có cầu thang lên xuống 2 bên đường.
Ga S5 - Lê Đức Thọ, dọc đường Hồ Tùng Mậu, gần trường Đại học Thương Mại.
Ga S6 - Đại học Quốc Gia, có cầu thang lên xuống 2 bên đường Xuân Thủy.
Ga S8 - Cầu Giấy, đối diện trường Đại học Giao thông.
Ga S9 - Kim Mã, gần khách sạn Daewoo, bắt đầu đi ngầm và có lối lên xuống bên phố Kim Mã.
Ga S11 - Văn Miếu, với thiết kế hài hòa với phong cách kiến trúc của Văn Miếu - Quốc Tử Giám.
Ga S12 - Ga Hà Nội - lối lên xuống trên phố Trần Hưng Đạo, ngay trước Ga Hà Nội, đây là nhà ga cuối cùng của dự án.
Theo báo cáo của Ban quản lý đường sắt đô thị Hà Nội, hiện nay các ga trên cao làm được khoảng 40% tiến độ, còn lại các ga ngầm chưa được thi công.
Tuyến đường sắt dự kiến đưa vào hoạt động năm 2021.