Theo đó, Bộ này thống nhất với việc bố trí nhà ga chính (ga ngầm) và cụm công trình phụ trợ theo Phương án Quy hoạch Tổng mặt bằng ga ngầm C9.
Bộ VHTTDL lưu ý, vị trí các lối lên xuống nhà ga theo Phương án Quy hoạch hiện nằm trong phạm vi khoanh vùng bảo vệ di tích quốc gia đặc biệt Hồ Hoàn Kiếm và Đền Ngọc Sơn. Đây là khu vực trọng yếu, gắn với truyền thuyết, lịch sử và văn hiến của Thủ đô… Để xử lý hài hòa mối quan hệ giữa bảo tồn và phát triển, Bộ đề nghị UBND TP. Hà Nội chỉ đạo Ban Quản lý ĐSĐT Hà Nội xây dựng thêm các phương án bố trí nhà ga, lối lên, lối xuống của ga C9 và biện pháp giảm thiểu tác động tới các yếu tố chứa đựng giá trị của di tích.