Nội dung thanh tra, kiểm tra tập trung vào các chương trình, dự án có vốn đầu tư lớn, các lĩnh vực quan trọng được dư luận xã hội quan tâm, như: Quản lý tài chính, điều hành và sử dụng ngân sách, quản lý sử dụng đất đai, đầu tư xây dựng cơ bản, các chương trình mục tiêu quốc gia… Thanh tra chuyên ngành tập trung vào các nội dung: Quản lý, điều hành và sử dụng tài chính, ngân sách; chống buôn lậu, gian lận thương mại, hàng giả, hàng kém chất lượng, vệ sinh an toàn thực phẩm…
Qua thanh tra đã phát hiện sai phạm về tiền là 2.477,02 triệu đồng, trong đó kiến nghị thu hồi 1.193,77 triệu đồng nộp ngân sách Nhà nước, đề nghị giảm trừ khi thanh toán 1.025,25 triệu đồng; quyết định xử phạt vi phạm hành chính 188 trường hợp với số tiền 957,4 triệu đồng; tước quyền sử dụng giấy phép lái xe có thời hạn đối với 36 trường hợp, buộc hạ tải 99,4 tấn hàng hóa các loại; thu giữ 1.000 kg hóa chất sử dụng trong sản xuất tăm đũa không rõ nguồn gốc.
