Đề án cũng xác định mục tiêu đổi mới hệ thống lựa chọn và khuyến khích đầu tư trực tiếp nước ngoài theo hướng đặt ra tiêu chí cụ thể nhằm thu hút các dự án thuộc lĩnh vực công nghiệp hỗ trợ, dự án có giá trị gia tăng cao, dự án sử dụng nhiều nguyên liệu, vật tư trong nước, dự án cam kết chuyển giao công nghệ tiên tiến,... Không cấp phép đối với các dự án tiêu tốn năng lượng, khai thác tài nguyên không gắn với chế biến, sử dụng công nghệ lạc hậu, gây ô nhiễm môi trường.
