Dự án đã khôi phục 44 cầu với tổng chiều dài 6.553 m và hơn 45.000 m đường sắt hai đầu cầu; cải tạo, làm mới 22 đường ngang; nâng cấp, cải tạo, làm mới 15 đường chui dưới cầu; xây mới 2 cầu vượt phía Nam ga Ninh Bình và phía Nam cầu Đò Lèn; xây dựng mới nhà ga Ninh Bình... Trong số này, công trình cầu đường sắt sông Bồ đánh dấu sự về đích của toàn bộ Dự án.
