Thông cáo báo chí về buổi làm việc cuối cùng hội nghị Trung ương 6 cho biết, sáng 11/10/2017, Ban chấp hành Trung ương họp phiên bế mạc tại hội trường. Uỷ viên Bộ Chính trị, Chủ tịch nước Trần Đại Quang thay mặt Bộ Chính trị điều hành phiên họp.
Uỷ viên Bộ Chính trị, Thủ tướng Chính phủ Nguyễn Xuân Phúc thay mặt Bộ Chính trị đọc Báo cáo của Bộ Chính trị tiếp thu và giải trình ý kiến Trung ương thảo luận về tình hình kinh tế - xã hội, ngân sách nhà nước năm 2017 và nhiệm vụ năm 2018.
Uỷ viên Bộ Chính trị, Phó Thủ tướng thường trực Chính phủ Trương Hoà Bình thay mặt Bộ Chính trị đọc Báo cáo của Bộ Chính trị tiếp thu và giải trình ý kiến Trung ương thảo luận về Đề án tăng cường công tác bảo vệ, chăm sóc và nâng cao sức khoẻ nhân dân trong tình hình mới.
Uỷ viên Bộ Chính trị, Phó Thủ tướng Chính phủ, Bộ trưởng Bộ Ngoại giao Phạm Bình Minh thay mặt Bộ Chính trị đọc Báo cáo của Bộ Chính trị tiếp thu và giải trình ý kiến Trung ương thảo luận về Đề án về công tác dân số trong tình hình mới.
Uỷ viên Bộ Chính trị, Phó Thủ tướng Chính phủ Vương Đình Huệ thay mặt Bộ Chính trị đọc Báo cáo của Bộ Chính trị tiếp thu và giải trình ý kiến Trung ương thảo luận về Đề án đổi mới cơ chế quản lý, cơ chế tài chính và tổ chức lại hệ thống các đơn vị sự nghiệp công lập.
Uỷ viên Bộ Chính trị, Bí thư Trung ương Đảng, Trưởng Ban Tổ chức Trung ương Phạm Minh Chính thay mặt Bộ Chính trị đọc Báo cáo của Bộ Chính trị tiếp thu và giải trình ý kiến Trung ương thảo luận về Đề án một số vấn đề về tiếp tục đổi mới, sắp xếp tổ chức bộ máy của hệ thống chính trị tinh gọn, hoạt động hiệu lực, hiệu quả.
Sau đó, Ban Chấp hành Trung ương Đảng đã biểu quyết thông qua Nghị quyết Hội nghị lần thứ sáu Ban Chấp hành Trung ương Đảng khoá XII. Tổng Bí thư Nguyễn Phú Trọng phát biểu bế mạc hội nghị.