Ngày 15/12/2022, Tổng cục Thuế đã chính thức vận hành Cổng thông tin thương mại điện tử để tiếp nhận thông tin về các tổ chức, cá nhân kinh doanh trên sàn giao dịch thương mại điện tử, đồng thời thiết kế chức năng khai thuế, nộp thuế trực tuyến trên Cổng thông tin thương mại điện tử, phối hợp với các sàn gắn liên kết dẫn đến Cổng thông tin thương mại điện tử trên giao diện của các sàn. Theo đó, các tổ chức là chủ sở hữu sàn giao dịch thương mại điện tử chỉ cần cung cấp thông tin qua Cổng thông tin của Tổng cục Thuế bằng phương thức điện tử.
Đến nay, sau 2 kỳ cung cấp thông tin (quý IV/2022 và quý I/2023), Cổng thông tin điện tử đã ghi nhận 333 sàn giao dịch thương mại điện tử thực hiện việc cung cấp thông tin, trong đó có nhiều sàn chiếm thị phần lớn như: Shopee, Lazada, Sendo, Voso, Tiki… Theo thông tin các sàn cung cấp, trong quý IV/2022 có 159.218 cá nhân và 31.882 tổ chức có hoạt động kinh doanh trên sàn giao dịch thương mại điện tử, với 50,7 triệu lượt giao dịch và tổng giá trị giao dịch là 15.272 tỷ đồng; trong quý I/2023 (tính đến ngày 24/6/2023) có 64.327 cá nhân và 22.840 tổ chức kinh doanh trên sàn giao dịch thương mại điện tử, với 9 tỷ lượt giao dịch và tổng giá trị giao dịch là 11.478 tỷ đồng.
Về công tác thanh tra, kiểm tra, Tổng cục Thuế đã phân công nhiệm vụ triển khai công tác kiểm tra, đối chiếu thông tin đối với một số người nộp thuế là chủ sở hữu sàn thương mại điện tử, các đơn vị là trung gian thanh toán, các công ty đối tác nước ngoài tại Việt Nam và một số NCCNN không có cơ sở kinh doanh cố định tại Việt Nam. Đến nay, đã ban hành và tiến hành kiểm tra tại 15/18 doanh nghiệp và đã hoàn thành, ban hành quyết định xử lý đối với 13 doanh nghiệp, với tổng số tiền xử lý, phạt, truy thu thuế, lệ phí là 129,1 tỷ đồng, giảm lỗ 986 tỷ đồng, giảm khấu trừ thuế giá trị gia tăng 113,9 tỷ đồng.
Theo thống kê của Tổng cục Thuế, tổng số thu thuế đối với hoạt động thương mại điện tử từ các tổ chức, cá nhân Việt Nam có thu nhập từ cung cấp dịch vụ trên nền tảng số, thu nhập từ hoạt động kinh doanh thương mại điện tử cho các tổ chức nước ngoài trên toàn quốc năm 2021 là 261 tỷ đồng, năm 2022 tăng cao với 716 tỷ đồng, bằng 274% số thu năm 2021; 5 tháng đầu năm 2023 đạt 246 tỷ đồng, bằng 34% số thu năm 2022.
